A gestão escolar da rede municipal é instituída e mantida por um sistema próprio de ensino que é de responsabilidade da SEMED e, atualmente, atende a sessenta e t quatro escolas públicas na área urbana e rural do Município
Na área urbana de Mojuí dos Campos são seis escolas trabalhando com a educação infantil básica:
Escola Maria do Carmo
Escola Artur Calazans
Escola Júlio Walfredo
Escola Raimunda Queiroz
Escola Francisco Chagas
Escola Santa Terezinha
Outras cinquenta e cinco escolas que compõem a rede pública estão distribuídas em cento e vinte e três comunidades em Mojuí dos Campos.
As escolas trabalham a partir da educação infantil básica até o ensino fundamental.
Visão
A educação, direito de todos, é um dever do Município e será promovida e incentivada com a colaboração da sociedade, baseada nos princípios da democracia, da liberdade de expressão, da solidariedade e do respeito aos direitos humanos.
Visando constituir-se em um instrumento de desenvolvimento da capacidade de elaboração e de reflexão crítica da realidade, a Secretaria Municipal de Educação SEMED, promove a educação básica para quatro mil quinhentos e cinquenta e três alunos da rede pública de ensino de Mojuí dos Campos
A SEMED foi criada no Município de Mojuí dos Campos em 15 de janeiro de 2013 pela Lei Municipal nº001, com a missão de suplementar e promover a educação na rede pública municipal regular, bem como a educação especializada - educação especial na perspectiva da Educação Inclusiva - atendendo aos parâmetros da Lei de Diretrizes e Bases da Educação LDB Lei nº9394/96.